Actividades

FINALIZADO

CURSO

Curso Virtual: Herramientas de Bioinform?tica Aplicadas al An?lisis de Secuencias Nucleot?dicas y de Prote?nas
Organizado por la SUBCOMISION DE MICROBIOLOGIA MOLECULAR Y CELULAR

Fecha de inicio: miércoles 9 de septiembre.

Duración: del 9/9/20 al 28/10/20 (todos los miércoles se habilitará una nueva clase/actividad).

La última clase (28/10) de 10-12 hs está programada la actividad integradora (a través de la plataforma Zoom).

Coordinación: Pablo Power.

Docentes: Pablo Power, Alfonso Soler, Marisa Farber, Marcos Paolinelli, Luciano Calderón, Andrés Morales

Objetivos:

-          Introducir a los participantes en los conceptos y las aplicaciones a través de ejemplos prácticos de las herramientas básicas para el análisis bioinformático de secuencias (nucleotídicas y aminoacídicas) y genomas bacterianos (plásmidos, cromosomas bacterianos) y

-          Conocer algunas de las herramientas bioinformáticas utilizadas para la interpretación de resultados provenientes del uso de tecnología de secuenciación de alto rendimiento o NGS (nextgenerationsequencing) Comprender el uso de comandos para el análisis bioinformático básico

-          Brindar conocimientos básicos para la interpretación de experimentos de modelado proteico.

Resumen:

La Bioinformática constituye una aproximación que atraviesa de manera transversal todas las áreas asociadas a las ciencias biológicas. Sus herramientas tienen una aplicación y un uso cada vez más frecuente, tanto en laboratorios de investigación básica como aplicada, abarcando a su vez servicios profesionales de especialidades clínicas, agropecuarias y ambientales. En este curso virtual proponemos abordar los conceptos básicos que sustentas las diferentes herramientas de bioinformática y sus aplicaciones, incluyendo aquellas utilizadas para el análisis de secuencias nucleotídicas y aminoacídicas, el análisis filogenético, la secuenciación masiva (NGS), y análisis de genomas cromosómicos y plasmídicos bacterianos. Los contenidos están pensando para una audiencia sin formación específica en bioinformática y/o que requiera de una profundización de conceptos básicos para mejorar el uso de las herramientas disponibles.

Modalidad del curso:

Curso online que consiste en una clase semanal teórica (7 clases), que incluirán, cuando corresponda, tutoriales y/o actividades mostrativas y ejercicios de aplicación para ser resueltos por los alumnos. Las clases estarán grabadas, las actividades contarán con un instructivo detallado, y todo el material estará disponible para que los participantes puedan acceder de acuerdo a su conveniencia.

La última clase (clase 8) consistirá en una clase sincrónica por videoconferencia a través de la plataforma Zoom, en donde todos los docentes participarán en la realización conjunta de una actividad práctica integradora sobre un material que será enviado previamente, y de esta forma responder dudas y resolver consultas que se hayan generado a los largo de las clases no sincrónicas.

Al finalizar el curso, se tomará una evaluación

El participante podrá organizar el tiempo durante la cursada de acuerdo a su disponibilidad, siempre que cumpla con todas las actividades propuestasdurante a lo largo de la extensión de tiempo del curso.

El curso cumple con los requisitos de la mayoría de los posgrados, posee evaluación final y 20 hs. cátedra, pero su validez para sumar horas requeridas para un doctorado depende de cada escuela de posgrado.

TEMARIO:

• Clase 1 (9/9/20): Introducción a las herramientas básicas de análisis de secuencias de ADN: diseño de primers, Blast, multialineamientos. Tutorial de herramientas online. P. Power
• Clase 2 (16/9/20): NGS: introducción general (RNAseq y metagenómica). M. Paolinelli.
• Clase 3 (23/9/20): Genomas bacterianos. Replicación, estructura, secuencia (técnicas, propiedades, bases de datos). Plásmidos bacterianos. Estructura, propiedades y técnicas para su estudio y análisis. A. Soler
• Clase 4 (30/9/20):Secuenciación de genomas bacterianos. (Comparación de diferentes tecnologías NGS). M. Farber
• Clase 5 (7/10/20):Variantcalling, filogenia. L. Calderón
• Clase 6 (14/10/20):Taller práctico (tutorial): ejemplo blast y multiple alineamiento: demostración en línea de comandos. M. Paolinelli y A. Morales
• Clase 7 (21/10/20):Bioinformática de proteínas: introducción al análisis de secuencias de proteínas, blast, multialign, predicción de dominios, etc. Nociones de modelado in silico de proteínas. P. Power
• Clase 8 (28/10/20):Videoconferencia por Zoom con todos los docentes. Taller práctico integrativo. Resumen, preguntas, resolución de ejercicios de los talleres. De 10 a 12 hs.

ARANCELES:

* Socios AAM: éste beneficio se otorgará solamente a los asociados que tengan al día sus cuotas societarias y 1 año de antigüedad como mínimo; ó a los que se asocien abonando un año por adelantado.

** Estudiante socio: asociados a la AAM en categoría de “Estudiante”; estudiantes de postgrado afiliados en categoría "Adherente" ó "Titular" con menos de 5 años de obtenido el título de grado.

*** Estudiante no socio: estudiante de grado, Maestría, Doctorado ó Residentes, que presenten un certificado actualizado acreditando su condición.

**** No Socios con Convenio: encuentre aquí el listado de entidades (http://www.aam.org.ar/convenio.php); recuerde que deberá presentar un certificado de la misma que acredite su pertenencia.

FORMAS DE PAGO:

• DÉBITO AUTOMÁTICO - medio exclusivo para socios que se encuentren adheridos a dicho sistema y abonen sus cuotas de ésa manera; solamente deberá seleccionar ésta opción y nosotros realizaremos el débito correspondiente.
• PAYU - plataforma online de pago seguro que le permitirá abonar el arancel con diferentes tarjetas de crédito, débito, Rapipago ó Pagofacil. Deberá marcar ésta opción y seguir las instrucciones del sitio al que se le redirigirá para emitir el cupón de pago correspondiente.

ATENCIÓN - LA INSCRIPCIÓN SE ENCUENTRA CERRADA.-

Informes: registro@aam.org.ar