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09/09/2020
Curso Virtual: Herramientas de Bioinformtica Aplicadas al Anlisis de Secuencias Nucleotdicas y de Protenas
Organizado por la SUBCOMISION DE MICROBIOLOGIA MOLECULAR Y CELULAR

Fecha de inicio: miércoles 9 de septiembre

Duración: del 9/9/20 al 28/10/20 (todos los miércoles se habilitará una nueva clase/actividad). La última clase (28/10) de10-12 hsestá programada la actividad integradora (a través de la plataforma Zoom).

Coordinación: Pablo Power

Docentes: Pablo Power, Alfonso Soler, Marisa Farber, Marcos Paolinelli, Luciano Calderón, Andrés Morales

Dirigido a profesionales de las ciencias biológicas y estudiantes de carreras afines, con especial énfasis en Microbiología

 

Objetivos:

-          Introducir a los participantes en los conceptos y las aplicaciones a través de ejemplos prácticos de las herramientas básicas para el análisis bioinformático de secuencias (nucleotídicas y aminoacídicas) y genomas bacterianos (plásmidos, cromosomas bacterianos) y

-          Conocer algunas de las herramientas bioinformáticas utilizadas para la interpretación de resultados provenientes del uso de tecnología de secuenciación de alto rendimiento o NGS (nextgenerationsequencing) Comprender el uso de comandos para el análisis bioinformático básico

-          Brindar conocimientos básicos para la interpretación de experimentos de modelado proteico.

 

Resumen:

La Bioinformática constituye una aproximación que atraviesa de manera transversal todas las áreas asociadas a las ciencias biológicas. Sus herramientas tienen una aplicación y un uso cada vez más frecuente, tanto en laboratorios de investigación básica como aplicada, abarcando a su vez servicios profesionales de especialidades clínicas, agropecuarias y ambientales. En este curso virtual proponemos abordar los conceptos básicos que sustentas las diferentes herramientas de bioinformática y sus aplicaciones, incluyendo aquellas utilizadas para el análisis de secuencias nucleotídicas y aminoacídicas, el análisis filogenético, la secuenciación masiva (NGS), y análisis de genomas cromosómicos y plasmídicos bacterianos. Los contenidos están pensando para una audiencia sin formación específica en bioinformática y/o que requiera de una profundización de conceptos básicos para mejorar el uso de las herramientas disponibles.

 

Modalidad del curso:

Curso online que consiste en una clase semanal teórica (7 clases), que incluirán, cuando corresponda, tutoriales y/o actividades mostrativas y ejercicios de aplicación para ser resueltos por los alumnos. Las clases estarán grabadas, las actividades contarán con un instructivo detallado, y todo el material estará disponible para que los participantes puedan acceder de acuerdo a su conveniencia.

La última clase (clase 8) consistirá en una clase sincrónica por videoconferencia a través de la plataforma Zoom, en donde todos los docentes participarán en la realización conjunta de una actividad práctica integradora sobre un material que será enviado previamente, y de esta forma responder dudas y resolver conjuntas que se hayan generado a los largo de las clases no sincrónicas.

Al finalizar el curso, se tomará una evaluación

El participante podrá organizar el tiempo durante la cursada de acuerdo a su disponibilidad, siempre que cumpla con todas las actividades propuestasdurante a lo largo de la extensión de tiempo del curso.

 

Temario:

o   Clase 1 (9/9/20): Introducción a las herramientas básicas de análisis de secuencias de ADN: diseño de primers, Blast, multialineamientos. Tutorial de herramientas online. P. Power

o   Clase 2 (16/9/20): NGS: introducción general (RNAseq y metagenómica). M. Paolinelli.

o   Clase 3 (23/9/20): Genomas bacterianos. Replicación, estructura, secuencia (técnicas, propiedades, bases de datos). Plásmidos bacterianos. Estructura, propiedades y técnicas para su estudio y análisis. A. Soler

o   Clase 4 (30/9/20):Secuenciación de genomas bacterianos. (Comparación de diferentes tecnologías NGS). M. Farber

o   Clase 5 (7/10/20):Variantcalling, filogenia. L. Calderón

o   Clase 6 (14/10/20):Taller práctico (tutorial): ejemplo blast y multiple alineamiento: demostración en línea de comandos. M. Paolinelli y A. Morales

o   Clase 7 (21/10/20):Bioinformática de proteínas: introducción al análisis de secuencias de proteínas, blast, multialign, predicción de dominios, etc. Nociones de modelado in silico de proteínas. P. Power

o   Clase 8 (28/10/20):Videoconferencia por Zoom con todos los docentes. Taller práctico integrativo. Resumen, preguntas, resolución de ejercicios de los talleres. De 10 a 12 hs.

 

INSCRIPCION del 3/8 al 1/9/2020

 

ARANCELES

SOCIO:      $ 3500  

NO SOCIO  $ 7000

SOCIO DE SOCIEDAD CON CONVENIO: $ 3500 

ESTUDIANTE SOCIO:    $ 1750

ESTUDIANTE NO SOCIO:$ 3500

EXTRANJEROS: U$S 200

 

INSCRIPCION: 

Para inscribirse ingrese sus datos en el siguiente enlace y será redireccionado a una pagina de pago seguro

https://aam.org.ar/cursos/inscripcion_cursos.php?e=129

 

Informes: registro@aam.org.ar

 

 

 

 



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