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08/09/2020
CURSO VIRTUAL Fundamentos de qPCR y RT-qPCR y sus aplicaciones en ecologa microbiana.
Organizado por DiMAyA

Curso Virtual "Fundamentos de qPCR y RT-qPCR y sus aplicaciones en ecología microbiana".-

 

Organizado por DiMAyA - AAM

 

Coordinación: Dra. Irma Morelli

 

Docentes: Dras. Ana Carolina Agnello, Sabrina Festa, Marianela Macchi y Laura Madueño

 

Resumen

El curso revisa las diferentes aplicaciones de la técnica de PCR cuantitativa (qPCR) y sus usos en el estudio de comunidades microbianas. Se centra además en las bases y fundamentos de esta técnica y hace especial hincapié en los requerimientos teóricos y prácticos para la obtención de resultados confiables.

El curso abarca la cuantificación absoluta y la cuantificación relativa, con especial enfoque a la expresión diferencial de genes. Se comparan las opciones de químicas disponibles para su análisis como sondas TaqMan® o SYBR Green®.

Se incluyen además sesiones donde se profundizará en el diseño de primers y estándares, en el diseño experimental de la técnica, análisis de datos, resolución de problemas e interpretación de los resultados.

 

Metodología

Curso on-line, teóricos y seminarios de aplicación y discusión de problemas, con Evaluación final.

Para recibir el certificado de aprobación del curso se deberá cumplir con el 80% de las actividades previstas y la aprobación de la evaluación final. Los alumnos que cumplan con la asistencia y las actividades pero no realicen ó no aprueben el examen final recibirán un certificado de participación. El curso cumple con los requisitos de la mayoría de los posgrados, posee evaluación final y 45 h cátedra, pero su validez para sumar horas requeridas para un doctorado depende de cada escuela de posgrado.

 

Fecha de inicio: 8 de septiembre. Duración 9 semanas.

 

 

Objetivos

-Comprender el fundamento de la técnica de PCR cuantitativa (qPCR) y RT-qPCR, sus posibles aplicaciones al estudio de estructura, dinámica y función de las comunidades microbianas, sus alcances y limitaciones.

-Conocer las consideraciones prácticas para obtener resultados representativos y confiables

-Discutir los distintos métodos de cuantificación dependiendo de las posibilidades y necesidades de cada ensayo.

-Comprender las distintas estrategias computacionales para el diseño de primers dirigidos a genes funcionales.

 

Temario

  • PCR en tiempo real (qPCR) fundamentos: PCR convencional vs qPCR. Cinética de amplificación. Aplicación de qPCR y RT-PCR al estudio de comunidades microbianas.
  • Ensayo qPCR: Generalidades y terminología. Cuantificación absoluta y relativa. Equipos disponibles en el mercado, funcionamiento básico del equipo, tipos de fluoróforos
  • Extracción de ADN y ARN a partir de muestras ambientales y para ser utilizadas en ensayos de qPCR.
  • Diseño/selección de cebadores para la detección funcional en ensayos de qPCR: Asignación taxonómica y predicción funcional in silico de genes de interés a través de datos de secuenciación del gen 16S rRNA (Illumina). Detección de genes de interés a partir de datos genómicos y metagenómicos.
  • Método de cuantificación absoluta (número de copias): Construcción paso a paso de patrones de ADN que relacionen los valores de Ct con el número de copias. Patrones construidos a partir de productos PCR purificados, plásmidos recombinantes o ADN total de una bacteria con el gen de interés. Ventajas, desventajas y limitaciones
  • Método de cuantificación relativa (en relación a un gen constitutivo): Tipos de genes constitutivos utilizados, ventajas y desventajas. Validación de primers: especificidad y curvas de eficiencia. El método ΔΔCt.
  • Consideraciones prácticas en un ensayo de qPCR: Condiciones del laboratorio, cuidados y preparación de reactivos, concentraciones y volúmenes de la muestra a cuantificar, preparación experimental del ensayo. Controles del ensayo, controles de inhibición, controles de especificidad (curvas de meltting).
  • Análisis de resultados: Uso de software específico, generalidades de los programas de análisis de datos y estadística.
  • Revisión del papel de la qPCR en el estudio de comunidades microbianas: cuantificación de la abundancia y expresión de marcadores genéticos taxonómicos y funcionales dentro de una comunidad microbiana. Análisis y discusión de distintas aplicaciones. Combinación con otros enfoques para la comprensión de la función y dinámica de la comunidad microbiana.

 

ARANCELES DE INSCRIPCION:

 

SOCIOS AAM *

$ 3500.-

NO SOCIOS

$ 7000.-

ESTUDIANTES SOCIOS AAM **

$ 1750.-

ESTUDIANTES NO SOCIOS ***

$ 3500.-

NO SOCIOS MIEMBROS DE ENTIDADES CON CONVENIO

$ 3500.-

EXTRANJEROS

U$S 200.-

 

Socios AAM: éste beneficio se otorgará solamente a los asociados que tengan al día sus cuotas societarias y 1 año de antigüedad como mínimo; ó a los que se asocien abonando un año por adelantado.

** Estudiante socio: asociados a la AAM en categoría de “Estudiante”; estudiantes de postgrado afiliados en categoría "Adherente" ó "Titular" con menos de 5 años de obtenido el título de grado.

*** Estudiante no socio: estudiante de grado, Maestría, Doctorado ó Residentes, que presenten un certificado actualizado acreditando su condición.

 

ATENCIÓN - LA INSCRIPCIÓN CIERRA EL DÍA 1 DE SEPTIEMBRE.-

 

INSCRÍBASE AQUÍ --> https://aam.org.ar/cursos/inscripcion_cursos.php?e=124

 

INFORMES: registro@aam.org.ar 



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(54-11) 4932-8948
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